Определением Поместного Собора Русской Православной Церкви 27-28 января 2009 г. Священному Синоду была поручена разработка «должного механизма общецерковного обсуждения вопросов, поставленных на заседаниях Поместного Собора» («О жизни и трудах Русской Православной Церкви», п. 6).
Во исполнение соборного определения Священный Синод на заседании 31 марта 2009 г. (журнал № 19) создал Комиссию по образованию Межсоборного присутствия Русской Православной Церкви.
Комиссия под председательством Патриарха Московского и всея Руси и сформированная ею рабочая группа подготовили проект Положения о Межсоборном присутствии Русской Православной Церкви, а также предложения по составу, повестке дня и плану работ присутствия.
На заседании Священного Синода, проходившем 27 июля 2009 г. в Киеве, были утверждены Положение о Межсоборном присутствии Русской Православной Церкви, состав и президиум этого органа, а также определен круг вопросов, входящих в его компетенцию (журнал № 55).
Священным Синодом было принято решение включить в повестку дня Межсоборного присутствия следующие вопросы:
- богословия;
- церковного управления и механизмов осуществления соборности в Церкви;
- церковного права;
- богослужения и церковного искусства;
- приходской жизни и приходской практики;
- организации церковной миссии;
- организации жизни монастырей и монашества;
- духовного образования и религиозного просвещения;
- организации церковной социальной деятельности и благотворительности;
- взаимодействия Церкви, государства и общества;
- противодействия церковным расколам и их преодоления;
- отношения к инославию и другим религиям;
- иные актуальные темы церковной жизни.