Образована путем выделения из состава Вологодской епархии. Включена в состав Вологодской митрополии.
Объединяет приходы в административных границах Великоустюгского, Бабушкинского, Кич-Городецкого, Никольского, Тотемского, Нюксенского, Тарногского районов Вологодской области.