Образована решением Священного Синода от 9 марта 2017 г. (журнал № 8) путем выделения из состава Архангельской епархии. Включена в состав Архангельской митрополии.
Объединяет приходы в административных границах Каргопольского, Онежского, Виноградовского, Плесецкого районов и ЗАТО «Мирный» Архангельской области.
Входит в состав Архангельской митрополии.
Правящему архиерею Синод постановил иметь титул «Плесецкий и Каргопольский».