Деятельность Отдела осуществляется по следующим основным направлениям: дошкольное православное воспитание в детских садах и яслях; образование в православных школах, гимназиях и лицеях; образование в высших православных учебных заведениях, занимающихся подготовкой православных педагогов и катехизаторов; воспитание и просвещение в воскресных школах; оглашение и посткрещальная катехизация.
Отдел осуществляет координацию и оказание помощи епархиям в развертывании ими образовательной деятельности, а также методическое и информационное обеспечение православных образовательных учреждений и координацию их деятельности. Важное место занимают издательская деятельность, а также рецензирование и грифование православной учебной литературы, для чего при Отделе создан Экспертный cовет. Информационная служба совместно с Российским православным университетом издает журнал «Православное образование».
С 1993 г. проводятся Международные Рождественские образовательные чтения под почетным председательством Святейшего Патриарха Московского и всея Руси, ставшие крупнейшим церковно-общественным форумом страны.