В декабре 1984 г. будущий Святейший Патриарх становится правящим архиереем Смоленской епархии.
С 1986 г. — управляющий приходами в Калининградской области.
С 1988 г. — архиепископ Смоленский и Калининградский.
25 февраля 1991 г. возведен в сан митрополита.
За время пребывания Святейшего Патриарха Кирилла на Смоленско-Калининградской кафедре (1984-2009 гг.) было открыто 166 приходов (94 в Смоленске и области, 72 в Калининграде и области). Восстановлено 52 и вновь построен 71 православный храм.
В 1989 г. было открыто Смоленское духовное училище, преобразованное в 1995 г. в Смоленскую духовную семинарию.
С 1992 г. ведется преподавание Основ православной культуры в государственных школах Смоленской и Калининградской области.
С 1998 г. действует Межъепархиальное духовное училище, готовящее регентов церковных хоров, катехизаторов, иконописцев и сестер милосердия.
При большинстве приходов епархии действуют воскресные школы. Имеются православные гимназии и детские сады.
1988 год. Загорск. Троице-Сергиева Лавра. Во время работы Поместного собора Русской Православной Церкви
1990 год. Москва. Данилов монастырь. Брифинг после подписания совместного коммюнике между Русской Православной Церковью и Минздравом СССР
19 ноября 2006 года. Калининград. Церемония присвоения митрополиту Смоленскому и Калининградскому Кириллу звания «Почетный гражданин города Калиниграда»